Koper jest znaną w Europie już w starożytności rośliną przyprawową. Młode pędy, czyli tzw. koperek stosowane są jako dodatek do bardzo wielu rodzajów potraw – sałatek, zup, sosów, zimnych przekąsek. Pędy z baldachami używane są natomiast podczas przygotowywania kiszonek – np. ogórków. Owoce zaś stosuje się w przygotowaniu kiszonej kapusty oraz stosuje jako przyprawę do zup czy sosów oraz przyrządza się z nich nalewki i likiery.
W kosmetyce wykorzystywany jest olejek koperkowy. Bywa on składnikiem produktów do higieny jamy ustnej np. past do zębów oraz ziołowych mydeł czy perfum.
W kuchni wykorzystuje się głównie ziele, w ziołolecznictwie natomiast owoce. Koper stosowany jest również jako surowiec zielarski o wielu leczniczych właściwościach. Przygotowuje się z niego napar, który działa uspokajająco, wspomaga proces trawienia i delikatnie obniża ciśnienie krwi. We względu na brak szkodliwych działań ubocznych stosowany jest więc również u małych dzieci jako lek przeciw kolce, trudnościom z trawieniem i spowodowaną tym bezsennością.
